这一季的故事发生在上一季的3年后。这一季里,托尼(卡洛斯·博纳德CarlosBernard饰)和米歇尔(蕾可·艾尔丝沃斯ReikoAylesworth饰)结婚了,并且成为了CTU的主管,而杰克(基弗·萨瑟兰KieferSutherland饰)的女儿金姆也加入CTU成为了一名情报分析员。剧情由一具被扔在洛杉矶卫生中心外并感染了致命病毒的尸体开始。一个墨西哥毒枭为了让美国政府释放自己的哥哥,以致命病毒为恐吓。杰克也因此又踏上了反恐调查之路。而这一季里面,杰克的调查并不顺利,为了打入毒贩内部,杰克不惜染上毒瘾,