民国年间，南京接连发生了多桩大案，警官程慈航临危受命，立案侦察。　　程慈航在助手杨玉琼的帮助下，取得证据并抓获绝色女贼李丽兰，但知李的凄惨身世后便网开一面放虎归林。此后李为报程慈航之恩多次协助破案

1945年，游学归来的刑侦专家程慈航，在码头遭遇险情，多方势力为争夺一只铁箱大开杀戒。这只铁箱里，存放着日军细菌武器的绝密档案。警察厅厅长莫采石将铁箱存放在了档案馆密室内，却在夜里档案被盗，案情从此扑